Особенности сооружения опор в сложных условиях: Сооружение ВЛ в районах с суровыми климатическими и тяжелыми геологическими условиями...

История создания датчика движения: Первый прибор для обнаружения движения был изобретен немецким физиком Генрихом Герцем...

Тема: Полимеразная цепная реакция (ПЦР)

2017-06-09 530
Тема: Полимеразная цепная реакция (ПЦР) 0.00 из 5.00 0 оценок
Заказать работу

Вверх
Содержание
Поиск

 

Универсальность, высокая чувствительность и относительная простота исполнения сделали метод ПЦР незаменимым для решения различных задач клинической диагностики, таких, как прямое обнаружение и идентификация возбудителей заболеваний, молекулярное типирование и исследование свойств патогенных микроорганизмов, анализ мутаций, связанных с генетическими заболеваниями у человека, идентификация личности человека.

Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – искусственный процесс многократного копирования (амплификации) специфической последова-тельности ДНК, осуществляемый in vitro. Копирование ДНК при ПЦР осуществляется специальным ферментом – ДНК-полимеразой, как и в клетках живых организмов. ДНК-полимераза, двигаясь по одиночной цепи ДНК (матрице), синтезирует комплементарную ей последовательность ДНК. Важно, что ДНК-полимераза не может начать синтез цепи ДНК «с нуля», ей необходимо короткая «затравочная» цепь РНК или ДНК, к которой она может начать присоединять нуклеотиды.

Механизм полимеразной цепной реакции:

1. Плавление двухцепочечной ДНК: перед началом реакции ДНК-мишень является двухцепочечной, при температуре 94-950С комплементарные цепи ДНК расходятся.

2. Отжиг праймеров: при температуре, оптимальной для выбранных праймеров, происходит их связывание с комплементарным участком ДНК-мишени.

3. Синтез новых цепей ДНК: ДНК-полимераза присоединяет нуклеотиды к праймерам, синтезируя новые цепи ДНК, которые становятся мишенью для праймеров в последующих циклах ПЦР.

4. Количество копий ДНК-мишени растет экспоненциально в последовательных ПЦР.

Основной принцип ПЦР состоит в том, что реакция полимеризации (синтеза полимерной цепи ДНК из мономерных нуклеотидных звеньев) инициируется специфическими праймерами (короткими фрагментами «затравочной» ДНК) в каждой из множества повторяющихся циклов.

Специфичность ПЦР определяется способностью праймеров «узнавать» строго определенный участок ДНК и связываться с ним согласно принципу молекулярной комплементарности.

В обычной реакции ПЦР используется пара праймеров, которые «ограничивают» амплифицируемый участок с двух сторон, связываясь с противоположными цепями ДНК-матрицы. Для многократного увеличения количества копий исходной ДНК нужна цикличность реакции.

ПЦР состоит из трех этапов:

1. Денатурация, или «плавление» ДНК, когда двухцепочечная ДНК под действием высокой температуры переходит в одноцепочечное состояние: двухцепочечную ДНК-матрицу нагревают до 94—96°C (или до 98 °C, если используется особенно термостабильная полимераза) на 0,5—2 мин., чтобы цепи ДНК разошлись.

2. Ренатурация (отжиг) праймеров с матричной ДНК: когда цепи разошлись, температуру понижают, чтобы праймеры могли связаться с одноцепочечной матрицей.

Время стадии — 0,5—2 мин.

Температура отжига зависит от состава праймеров и обычно выбирается на 4—5°С ниже их температуры плавления.

 

 

 

3. Элонгация, или удлинения цепи: ДНК-полимераза реплицирует матричную цепь, используя праймер в качестве затравки.

Полимераза начинает синтез второй цепи от 3'-конца праймера, который связался с матрицей, и движется вдоль матрицы.

Температура элонгации зависит от полимеразы. Часто используемые полимеразы Taq и Pfu наиболее активны при 72 °C.

Эта стадия длится 7-10 мин.

 

 

ПЦР проводят в амплификаторе - приборе, обеспечивающем периодичес-кое охлаждение и нагревание пробирок, обычно с точностью не менее 0,1 °C.

Современные амплификаторы позволяют задавать сложные программы, в том числе с возможностью «горячего старта», Touchdown ПЦР и последующего хранения амплифицированных молекул при 4 °C.

 

 

Схема ПЦР

 

 

 

 

Рис. 27 УФ бокс для выделения ДНК

Смена этапов каждого цикла осуществляется путем изменения температуры реакционной смеси. Сначала праймеры могут связаться только с определенной последовательностью исходной ДНК, но в последующих циклах они связываются с копиями этой последовательности, синтезированными в предыдущих циклах.

 


Поделиться с друзьями:

Поперечные профили набережных и береговой полосы: На городских территориях берегоукрепление проектируют с учетом технических и экономических требований, но особое значение придают эстетическим...

Историки об Елизавете Петровне: Елизавета попала между двумя встречными культурными течениями, воспитывалась среди новых европейских веяний и преданий...

Общие условия выбора системы дренажа: Система дренажа выбирается в зависимости от характера защищаемого...

Опора деревянной одностоечной и способы укрепление угловых опор: Опоры ВЛ - конструкции, предназначен­ные для поддерживания проводов на необходимой высоте над землей, водой...



© cyberpedia.su 2017-2024 - Не является автором материалов. Исключительное право сохранено за автором текста.
Если вы не хотите, чтобы данный материал был у нас на сайте, перейдите по ссылке: Нарушение авторских прав. Мы поможем в написании вашей работы!

0.015 с.