Навигация:

Главная Случайная страница Обратная связь ТОП Интересно знать Избранные Новые материалы

Топ:

Основы обеспечения единства измерений: Обеспечение единства измерений - деятельность метрологических служб, направленная на достижение...

История развития методов оптимизации: теорема Куна-Таккера, метод Лагранжа, роль выпуклости в оптимизации...

Методика измерений сопротивления растеканию тока анодного заземления: Анодный заземлитель (анод) – проводник, погруженный в электролитическую среду (грунт, раствор электролита) и подключенный к положительному...

Интересное:

Что нужно делать при лейкемии: Прежде всего, необходимо выяснить, не страдаете ли вы каким-либо душевным недугом...

Берегоукрепление оползневых склонов: На прибрежных склонах основной причиной развития оползневых процессов является подмыв водами рек естественных склонов...

Инженерная защита территорий, зданий и сооружений от опасных геологических процессов: Изучение оползневых явлений, оценка устойчивости склонов и проектирование противооползневых сооружений — актуальнейшие задачи, стоящие перед отечественными...

Дисциплины:

Автоматизация Антропология Археология Архитектура Аудит Биология Бухгалтерия Военная наука Генетика География Геология Демография Журналистика Зоология Иностранные языки Информатика Искусство История Кинематография Компьютеризация Кораблестроение Кулинария Культура Лексикология Лингвистика Литература Логика Маркетинг Математика Машиностроение Медицина Менеджмент Металлургия Метрология Механика Музыкология Науковедение Образование Охрана Труда Педагогика Политология Правоотношение Предпринимательство Приборостроение Программирование Производство Промышленность Психология Радиосвязь Религия Риторика Социология Спорт Стандартизация Статистика Строительство Теология Технологии Торговля Транспорт Фармакология Физика Физиология Философия Финансы Химия Хозяйство Черчение Экология Экономика Электроника Энергетика Юриспруденция

Полиморфность и гетерозиготность у Phoronopsis viridis

2017-12-21

266

0.00 из 5.00 0 оценок

Заказать работу

⇐ ПредыдущаяСтр 3 из 7Следующая ⇒

Проиллюстрируем вышесказанное на конкретном примере. В качестве исходных возьмем данные по оценке полиморфности и гетерозиготности популяции морского червя Phoronopsis viridis [1], сделанной на основе электрофоретического анализа 39 белков (39 локусов). Выборка составила 120 особей. В табл. 1 внесены только частоты аллелей 27 полиморфных локусов.

Анализ табл. 1 показывает, что полиморфность популяции без учета дополнительного критерия составляет Р = 27/39 = 0.692. После введения критерия полиморфности, равного 0.95, число полиморфных локусов сокращается до 11, а полиморфность становится равной Р_0.95 = 11/39 = 0.282.

Средние величины наблюдаемой и ожидаемой гетерозиготности (включая 12 мономорфных локусов) равны, соответственно:

Н_набл = 2.794/39 = 0.072; Н_ожид = 3.782/39 = 0.097. Для части полиморфных локусов (N_p=27) Н_набл = 2.794/27 = 0.103 и Н_ожид = 3.782/27 = 0.136.

Таблица 1

Обнаруженные экспериментально частоты аллелей 27 полиморфных локусов у

№.	Частоты аллелей	Гетерозиготность
п.п							Н_набл	Н_ожид
	0.995	0.005					0.010	0.010
	0.009	0.066	0.882	0.014	0.005	0.024	0.160	0.217
	0.472	0.528					0.224	0.496
	0.008	0.992					0.017	0.017
	0.076	0.924					0.151	0.140
	0.483	0.396	0.122				0.443	0.596
	0.010	0.979	0.012				0.025	0.041
	0.010	0.990					0.021	0.021
	0.986	0.014					0.028	0.028
	0.005	0.995					0.010	0.010
	0.040	0.915	0.017	0.011	0.011	0.006	0.159	0.161
	0.043	0.900	0.057				0.130	0.185
	0.996	0.004					0.008	0.008
	0.005	0.978	0.016				0.043	0.043
	0.992	0.008					0.017	0.017
	0.038	0.962					0.077	0.074
	0.014	0.986					0.028	0.027
	0.004	0.551	0.326	0.119			0.542	0.576
	0.008	0.987	0.004				0.025	0.025
	0.979	0.021					0.042	0.041
	0.017	0.824	0.159				0.125	0.296
	0.992	0.008					0.017	0.017
	0.955	0.005					0.010	0.010
	0.159	0.827	0.013				0.221	0.290
	0.038	0.874	0.071	0.017			0.185	0.229
	0.929	0.071					0.000	0.133
	0.008	0.004	0.962	0.013	0.013		0.076	0.074
Сумма:	2.794	3.782

В литературе имеется достаточно сведений о величинах полиморфности и гетерозиготности различных популяций. Одна из сводок представлена в табл. 2 [1].

Таблица2

Объект	Кол-во видов	Среднее	Средняя поли-	Средняя гетеро-	Н/Р**
		число	морф-	зигот-
		локусов	ность*	ность
Б е с п о з в о н о ч н ы е
Drosophila			0.529	0.150	0.284
Осы			0.243	0.062	0.255
Другие насекомые			0.531	0.151	0.284
Морские			0.439	0.124	0.282
Наземные улитки			0.437	0.150	0.343
П о з в о н о ч н ы е
Рыбы			0.306	0.078	0.255
Земноводные			0.336	0.082	0.244
Пресмыкающиеся			0.231	0.047	0.203
Птицы			0.145	0.042	0.290
Млекопитающие			0.206	0.051	0.248
Человек			0.282	0.067	0.238
Р а с т е н и я
Самоопылители			0.231	0.033	0.143
Перекрестноопылители			0.344	0.078	0.227
С р е д н е е п о г р у п п а м
Беспозвоночные			0.469	0.134	0.286
Позвоночные			0.251	0.061	0.243
Растения			0.264	0.046	0.174

*На использование критерия полиморфности ссылок нет.

**Параметр определен в дополнение к [1].

Справедлив вопрос: как интерпретировать достигнутый уровень разнообразия генотипов в популяциях различных организмов?

Прежде всего, обратим внимание на величину параметра полиморфности. Эта величина может оказаться заниженной, если был введен критерий полиморфности, но даже с учетом этого, по-видимому, половина всех локусов мономорфны.

Величину гетерозиготности, напомним, находят как среднюю по всем исследованным локусам, включая и те, которые мы считаем мономорфными. Поэтому средняя гетерозиготность по всем локусам явно ниже гетерозиготности, которую несут полиморфные локусы.

Так как гетерозиготность Н есть отношение суммы частот гетерозиготных генотипов Sg к общему числу изученных локусов N, включая и мономорфные (H = Sg/N), а полиморфность Р это доля ди- и полиаллельных локусов (Ng) P = Ng/N, отношение H/P = Sg/Ng соответствует средней гетерозиготности у полиморфных локусов. Необходимо обратить внимание, что введение критерия полиморфности уменьшает параметр Р и повышает отношение Н/Р. В соответствии с этим полученные значения средней гетерозиготности полиморфных локусов могут оказаться завышенными.

Используя уравнение (10) для n = (2 ¸ 6) и величины гетерозиготности у полиморфных локусов (Н/Р) из табл. 2, получаем частоты "ведущего" аллеля (табл. 3).

Таблица 3

Объект	Н/Р	Частоты “ведущего” аллеля р при различных значениях n
		n=2	n=3	n=4	n=5	n=6
Беспозвоночные	0.286	0.827	0.837	0.840	0.841	0.842
Позвоночные	0.243	0.858	0.865	0.867	0.868	0.868
Растения	0.174	0.904	0.906	0.907	0.908	0.908
Человек	0.238	0.862	0.868	0.870	0.871	0.871

С учетом возможного завышения уровня гетерозиготности Р значения р могут только возрасти. Таким образом, при выявленном уровне полиморфизма и гетерозиготности в пределах полиморфных локусов по частоте доминирует какой-то один аллель. Случаи, когда аллели представлены в равных пропорциях, встречаются довольно редко. Это заключение согласуется с данными табл. 1.

⇐ Предыдущая 1 234 5 6 7 Следующая ⇒

Поделиться с друзьями:

Эмиссия газов от очистных сооружений канализации: В последние годы внимание мирового сообщества сосредоточено на экологических проблемах...

Таксономические единицы (категории) растений: Каждая система классификации состоит из определённых соподчиненных друг другу...

Опора деревянной одностоечной и способы укрепление угловых опор: Опоры ВЛ - конструкции, предназначенные для поддерживания проводов на необходимой высоте над землей, водой...

Индивидуальные и групповые автопоилки: для животных. Схемы и конструкции...