Амплификация области гена МВ, содержащей тандемные повторяющиеся последовательности. — КиберПедия 

Таксономические единицы (категории) растений: Каждая система классификации состоит из определённых соподчиненных друг другу...

Наброски и зарисовки растений, плодов, цветов: Освоить конструктивное построение структуры дерева через зарисовки отдельных деревьев, группы деревьев...

Амплификация области гена МВ, содержащей тандемные повторяющиеся последовательности.

2022-12-20 18
Амплификация области гена МВ, содержащей тандемные повторяющиеся последовательности. 0.00 из 5.00 0 оценок
Заказать работу

Эти праймеры были использованы для ПЦР во всех сочетаниях, однако нам не удалось получить ампликоны теоретической расчетной длины во всех случаях. После серии опытов была выбрана пара праймеров MBS387 и UMA1213 как наиболее подходящая для получения продуктов амплификации области МВ гена, содержащей тандемные повторяющиеся последовательности. В общей сложности из 18 образцов ДНК, выделенных из разных клинических изолятов, получить ампликоны удалось только в 6 случаях (рис 12):

ЛИТЕРАТУРА

  • 1. Борхсениус С. Н. "Микоплазмы как объект биотехнологии". Биотехнология, 1987, том ╪3, 338-342.
  • 2. Борхсениус С. Н. Чернова О. А. Микоплазмы. Цитология, 1987, 29: 376-390.
  • 3. Каган Г. Я., Раковская И. В. "Микоплазма-инфекция в культурах ткани". Медицина. 1968.
  • 4. Клицунова Н.В., Быковский А.Ф., Смирнова Т.Д. и др.// Вестн. АМН ССР.-1976.-╪5.-С.81-86.
  • 5. Прозоровский С. В., Раковская И. В., Вульфович Ю. В. Медицинская микоплазмология. Москва, Медицина, 1995.
  • 6. Тимаков В. Д. "Роль L-форм бактерий и микоплазм в этиологии и патогенезе некоторых острых и хронических заболеваний". Вестник АМН СССР. 1976. Т. 5. С. 3-9.
  • 7. Шлегель Г. "Общая микробиология". Москва. "Мир". 1987.
  • 8. Bak A. L., Christiansen C., Stenderup A. "Bacterial genome sizes determined by DNA renaturation studies". Journal of General Microbiology. 1970.64: 377-380.
  • 9. Barile M.F., Crabowski M.W., Stephens E.B. et al. "Micoplasma hominis-tissue cell interactions: a review with new observations on phenotypic and genotypic properties". Sexually Trand. Dis. 10: 345-354.
  • 10. Bassegio, N., M.D. Glew, P.F. Markham, K.G. Whitehear, and G.F. Browning. 1996. Size and genomic location of the pMGA multigene family of Mycoplasma gallisepticum. Microbiology 142:1429-1435
  • 11. Baumann L. 1989. Untersuchung der Fahigkeiten von Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis und sieben anderer Mycoplasma-Spezies zur Hamadsorption, Spermadsorption, Hamolyse und Peroxidbildung. Arch. Exp. Veterinarenmed. 43(5):789-800
  • 12. Behrens, A., M. Heller, H. Kirchhoff, D. Yogev, and R. Rosengarten. 1994. A family of phase- and size-variant membrane surface lypoprotein antigenes (Vsps) of Mycoplasma bovis. Infect. Immun. 62:5075-5084.
  • 13. Bhugra B., Dybvig K. "High-frequency rearrangements in the cromosome of Micoplasma pulmonis correlate with phenotypic switching." Molec. Microbiol. 1992, 6 (9): 1149-1154.
  • 14. Bhugra, B., and K. Dygvig. 1992. High-frequency rearrangements in the chromosome of Mycoplasma pulmonis correlate with phenotipic switching. Mol. Microbiol. 6:1149-1154
  • 15. Bhugra, B., L.L. Voelker, N. Zou, H. Yu, and K. Dygvig. 1995. Mechanism of antigenic variation in Mycoplasma pulmonis: interwoven, site-specific DNA inversions. Mol. Microbiol. 18:703-714
  • 16. Boatman E.S.// The Mycoplasmas.- New York Academic Press, 1979.-Vol. 1.- P.233-239.
  • 17. Borts P., Greaves D.R. "Programmed gene rearrangements altering gene expression" Science. 1987, 235: 658-667.
  • 18. Bove J. B. "Molecular features of Mollicutes". Clinical Infections Diseases, 1993, 17(suppl.1): S10-31.
  • 19. Chandler D.K.F., Rasin S., Stephens E.B. et al. "Genomic and phenotypic analysis of Micoplasma pneumoniae strians." Infect. Immun. 1982. 38: 604-609.
  • 20. Christiansen G., Freundt E. A., Black F. T. "Genome size and deoxyribonucleic acid base composition of Thermoplasma acidophilum". International Journal of System Bacteriology. 1975. 25: 99-101.
  • 21. Citti, C., and K.S. Wise. 1995. Mycoplasma hyorhinis vlp gene transcription:critical role in fase variation and expression of surface lipoproteins. Mol. Microbiol. 18:649-660
  • 22. Dallo, S.F., A. Chavoya, and J.B. Baseman. 1990. characterization of the gene for a 30-kilo0dalton adesine-related protein of Mycoplasma pneuoniae. Infect. Immun. 58:4163-4165.
  • 23. De Silva, N.S., Quinn P.A. 1991. J. Clin. Microbiol. 29(7):1498-503
  • 24. Dramsi, S., P. Dehoux, and P. Cossard. 1993. Common features of gram-positive bacterial proteins in cell recognition. Mol. Microbiol. 9:1119-1121
  • 25. Dybvig, K. 1993. DNA rearrangements and phenotyping switching in prokaryotes. Mol. Microbiol. 10:465-471
  • 26. Fraser, C.M. at al. 1995. The minimal gene complement of Mycoplasma genitalium. Science 270:397-403.
  • 27. Himmelreich Ralf, Helga Plagens, Helmut Hilbert, Berta Reiner, Richard Herrmann. "Comparative analysis of the genomes of the bacteria Mycoplasma pneumoniae and Mycoplasma genitalium". Nuc. Acids Res., 1997. V. 25. No. 4. P. 701-712.
  • 28. Himmelreich, R., H. Hilbert, H. Plagens, E. Pirkl, B.C. Li, and R. Herrman. 1996. Complete sequence analysis of of the genome of the bacterium Mycoplasma pneumoniae. Nucleic Acids Res. 24:628-639.
  • 29. Hobot J.A., Williger W., Escaig J. et al.//J. Bact.-1985.-Vol. 162.-P.960-971
  • 30. Hoiseth S.K., Moxon E.R., Silver R.P. " Genes involved in Haemophilus influenzae type b capsule expression are part of an 18-kilobase tandem duplication". Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1986, 83: 1106-1110.
  • 31. Hollingshead S.K., Fischetti V.A., Scott J.R. "Size variation in group A streptococcal M protein is generated by homologous recombination between intragenic repeats." Molec. Gen. Genet. 10987, 207:196-203.
  • 32. Hollingshead, S.K., V.A. Fischetti, and J.R. Scott. 1987. Size variation in group A streptococcal M protein is generated by homologous recombination between intragenic repeats. Mol. Gen. Genet. 207:196-203
  • 33. Jensen, J.S., J. Blom, and K. Lind. 1994. Intracellular location of Mycoplasma genitalium in cultured Vero cells as demonstrated by electron microscopy. Int. J. Exp. Pathol. 75:91-98
  • 34. Kehoe, M.A. 1994. Cell-wall-associated proteins in gram-positive bacteria. 217-261
  • 35. Ladefoged S. A., Christiansen G. "Physical and genetic mapping of the genomes of five Mycoplasma hominis strains by pulsed-field gel electrophoresis". J. Bacteriol. 1992.174: 2199-207.
  • 36. Levinson, G., and G.A. Gutman. 1987. Slipped-strand mispairing: a major mechanism for DNA sequence evolution. Mol. Biol. Evol. 4:203-221.
  • 37. Lo, S.C., M.M. Hayes, H. Kotani, P.F. Pierce, D.J. Wear, P.B. Newton III, J.G. Tully, and J.W. Shih. 1993. Adhesion onto and invasion into mammalian cells by Mycoplasma penetrans: a newly isolated mycoplasma from patients with AIDS.
  • 38. Lysnyansky, I., and D. Yogev. Неопубликованные данные.
  • 39. Lysnyansky, I., R. Rosengarten, and D. Yogev. 1996. Phenotyping switching of variable surface lipoprotein in Mycoplasma bovis involves high-frequency chromosome rearrangements. J. Bacteriol. 178:5395-5401
  • 40. Marshall, A.J., R.J. Miles, and L. Richards. 1995. The phagocytosis of mycoplasmas. J. Med. Microbiol. 43:239-250
  • 41. Mernaugh, G.R., S.F. Dallo, S.C. Holt, and J.B.Baseman. 1993. Properties of adhering and nonadhering populations of Mycoplasma genitalium. Clin. Infect. Dis. 17(Suppl. 1):S69-S78
  • 42. Miles R. J. "Catabolism in Mollicutes". Journal of General Microbiology, 1992, 138: 1773-1783.
  • 43. Montagnier L. "Montagnier pursues the mycoplasma-AIDS link". Science, 1991, 251: 271.
  • 44. Morowitz H. J., Wallace D. C. "Genome size and life cycle of mycoplasma". Ann. N. Y. Acad. Sci., 1973, v. 225, p. 62-73.
  • 45. Muto et al. Nucleic Acids Res. 1984. 12: 8209-17.
  • 46. Myers W. F., Baca O. G., Wisseman C. L. "Genome size of Rickettsia burnetii". Journal of Bacteriology. 1980. 144: 460-461.
  • 47. Olson L.D., Shane S.W., Kapras A.A. et al. "Monoclonal antibodies to surface antigens of pathogenic Micoplasma hominis strain." Infect Immun. 1991, 59: 1683-1689.
  • 48. Precious B.L., Thirkell D., Russel W.C.// J. Gen. Microbiol.-1987.-Vol. 133.- P. 2659-2670
  • 49. Rasin S., Tully J.G., Rose D.L., Barile M.F. "DNA clevage patterns as indicators of genetic heterogenity among strains of Acholeplasma and Micoplasma species." J. Gen. Microbiol. 1983. 129: 1935-1944.
  • 50. Razin A., Razin S. "Methylated bases in mycoplasmal DNA". Nucleic Acids Res. 1980. 8: 1383-1390.
  • 51. Razin S. "Physiology of mycoplasmas". Adv. Microbiol. Physiol. 1973. 10: 1-80.
  • 52. Razin S., Yogev D., Naot Y. "Molecular biology and pathogenicity of mycoplasmas". Microbiology and Molecular Biology Reviews, 1998, 1094-1156.
  • 53. Razin, S. 1978. The mycoplasmas. Microbiol. Rev. 42:414-470.
  • 54. Robertson, B.D., and T.F. Meyer. 1992. Genetic variation in pathogenic bacteria. Trends Genet. 8:422-427
  • 55. Rogers M. J., Simmons J., Walker R. T. et al. Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1985. Vol. 82, p. 1160-1164.
  • 56. Rosengarten R., Wise K.S. "Phenotypic switching in mycoplasmas phase variation of diverse surface lipoproteins." Science. 1990, 247: 315-318.
  • 57. Rosengarten R., Wise K.S. "The Vlp system of Micoplasma hyorhinis: combinanorial expression of distinct size variant lipoproteins generating high-frequency surface antigenic variation." J. Bacteriol. 1991, 173: 4782-4793.
  • 58. Rosengarten, R., A. Behrens at al. 1994. Antigene heterogeneity among isolates of Mycoplasma bovis is generated by high-frequency variation of diverse membrane surface proteins. Infect. Imun. 62:5066-5074.
  • 59. Rosengarten, R., and K.Wise. 1990. Phenotyping switching in mycoplasmas: phase variation of diverse surface lipoproteins. Science. 247:315-318.
  • 60. Rosengarten, R., and K.Wise. 1991. The Vlp system of Mycoplasma hyorhinis: combinatorial expression of distinct size variant lipoproteins generating high-frequency surface antigenic variation. J. Bacteriol. 173:4782-4793.
  • 61. Saada A.B, Terespolski Y, Adoni A, Kahane I. 1991. Infect. Immun. 59(1):467-9
  • 62. Seifert H.S., So M. "Genetic mechanisms of bacterial antigenic variation." Microbiol Rev. 1988, 52: 327-336.
  • 63. Simmons, W.L., C. Zhuhua, J.I. Glass, J.W. Simecke, G.H. Gassel, and H.L. Watson. 1996. Sequence analisis of the chromosomal region around and within the V-1 -encoding gene of Mycoplasma pulmonis: evidence for DNA inversions as a mechanism for V-1 variation. Infect. Immun. 64:472-479
  • 64. Smith D.G, Russel W.C, Thirkell D. 1994. Adherence of Ureaplasma urealyticum to human epithelial cels. Microbiology. 140 (Pt 10):2893-8
  • 65. Spooner, R.K, Russel W.C, Thirkell D. 1992. Characterisation of the immunoglobulin A proteinase of Ureaplasma urealyticum. Infect. Immun. 60(6):2544-6
  • 66. Stephens E.B., Aulakh G.S., Rose D.L., Tully J.G., Barile M.F. "Interspecies and intraspecies DNA homology among established species of Acholeplasma: a review" Yale J. Biol. Med. 1983. 56: 729-735.
  • 67. Swanson, J., R.J. Belland, and S.A. Hill. 1992. Neisserial surface variation: how and why? Curr. Opin. Genet. Dev. 2:805-811
  • 68. Theiss, P., and K.S. Wise. 1997. Localized frameshift mutation generates high-frequency phase variation of a surface lipoprotein encoded by mycoplasma ABC transporter operon. J. Bacteriol. 179:4013-4022
  • 69. Thirkell D., Precious B.L., Myles A.D.// Abst. 7-th Congr. IOM - Baden, Austria, 1988.- P. 70
  • 70. Watson, H.L., D.K. Blalock, and G.H. Gassell. 1990. Variable antigens of Ureaplasma urealyticum containing both serovar-specific and serovar cross-reacting epitopes. Infect. Immun. 58:3679-3688
  • 71. Watson, H.L., X. Zheng, and G.H. Gassell. 1993. Structural variations and phenotypic switching of mycoplasmal antigens. Clin. Infect. Dis. 17(Suppl 1):S183-S186
  • 72. Woese C. R., J. Maniloff & L. B. Zablen "Phylogenic analysis of the mycoplasmas". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1980. 77: 494-498.
  • 73. Yogev, D., R. Rosengarten, R. Watson-McCown, and K.S. Wise. 1991. Molecular basis of mycoplasma surface antigenic variation: a novel set of divergent genes undergo spontaneous mutation of periodic coding region and 5` regulatory sequences. EMBO J. 10:4069-4079
  • 74. Zhang, Q., and K.S. Wise. 1996. Molecular basis of size and antigenic variation of a Mycoplasma hominis adhesine encoded by divergent vaa genes. Infect. Immun. 64:2737-2744.
  • 75. Zhang, Q., and K.S. Wise. 1997. Localized reversible frameshift in an adhesin gene conferse a phase-variable adherence phenotype in mycoplasma. Mol. Microbiol. 25:859-869
  • 76. Zheng, X., H.L. Watson, K.B. Waites, and G.H. Gassell. 1992. Serotype diversity and antigen size variation among inasive isolates of Ureaplasma urealyticum from neonates. Infect. Immun. 60:3472-3474.
  • 77. Zheng, X., L.J. Teng, H.L. Watson, J.I. Glass, A. Blanchard, and G.H. Gassel. 1995. Small repeating units within the Ureaplasma urealyticum MB antigene gene encode serovar specificity and are associated with antigene size variation. Infect. Immun. 63:891-898.
  • 78. А.В. Жданов, Э.В. Малинина, О.В Бурменская, Л.З. Файзуллин, В.И. Кулаков, Г.Т. Сухих, М.Ю. Бродский, В.М. Говорун, Э.М. Халилов. 1991. Выявление Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis и Ureaplasma urealyticum методом полимеразной цепной реакции при патологиях репродуктивной системы мужчин и женщин. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины N 5.

 


Поделиться с друзьями:

Индивидуальные и групповые автопоилки: для животных. Схемы и конструкции...

Биохимия спиртового брожения: Основу технологии получения пива составляет спиртовое брожение, - при котором сахар превращается...

История развития пистолетов-пулеметов: Предпосылкой для возникновения пистолетов-пулеметов послужила давняя тенденция тяготения винтовок...

Кормораздатчик мобильный электрифицированный: схема и процесс работы устройства...



© cyberpedia.su 2017-2024 - Не является автором материалов. Исключительное право сохранено за автором текста.
Если вы не хотите, чтобы данный материал был у нас на сайте, перейдите по ссылке: Нарушение авторских прав. Мы поможем в написании вашей работы!

0.007 с.