Поперечные профили набережных и береговой полосы: На городских территориях берегоукрепление проектируют с учетом технических и экономических требований, но особое значение придают эстетическим...
Типы оградительных сооружений в морском порту: По расположению оградительных сооружений в плане различают волноломы, обе оконечности...
Топ:
Оснащения врачебно-сестринской бригады.
Методика измерений сопротивления растеканию тока анодного заземления: Анодный заземлитель (анод) – проводник, погруженный в электролитическую среду (грунт, раствор электролита) и подключенный к положительному...
Особенности труда и отдыха в условиях низких температур: К работам при низких температурах на открытом воздухе и в не отапливаемых помещениях допускаются лица не моложе 18 лет, прошедшие...
Интересное:
Средства для ингаляционного наркоза: Наркоз наступает в результате вдыхания (ингаляции) средств, которое осуществляют или с помощью маски...
Влияние предпринимательской среды на эффективное функционирование предприятия: Предпринимательская среда – это совокупность внешних и внутренних факторов, оказывающих влияние на функционирование фирмы...
Как мы говорим и как мы слушаем: общение можно сравнить с огромным зонтиком, под которым скрыто все...
Дисциплины:
2017-07-09 | 222 |
5.00
из
|
Заказать работу |
|
|
В дополнение к поиску последовательности сходство с БЛАСТНЫЕ Алгоритмов для ДНК - и
Белковых последовательностей были ORFs фаги в P482 также на предмет наличия
определенные аминокислоты анализирует мотив. Это возникает, например амино кислоты мотив
[LIMAC]-[LIVFYWA]-x-[DN]-P-P-[FYW] выделяет программу на PROSITE
Сходство с ДНК(аденин-н6)-Метил Трансфер Асен (PS00092). "АТП-GTP
binding site A (P-Loop)"мотив описан [AG]-x(4)-G-K-[ST].
Как Tab. 26 показывает, содержат некоторые белковые последовательности фаги характерные P482
Аминокислотные мотивы. Для HNH-Endonukleasen была типичная последовательность разделе
независимо от нескольких программах ORFs в 37 и 50 идентифицирован. Через
BLAST-сравнение найденных результатов, что ORF 22 для N-Acetylmuramoyl
L-аланин-Amidase, была подтверждена 2 программы. Хотя P482-
специфические ORF 32 нет сходства Последовательности клали в базах данных за ДНК
P482_ORF37:
P482_ORF50:
bIL170_E11:
bIL170_E20:
bIL170_E37:
r1t_ORF41:
SP82
:
Пхи-E:
P482_ORF47:
*
*
*
*
------------MKKIMEVVRYK--EKYLVSDKГDVFKENKKYTIKKKQATNKYGYKVTKI----НГKQE
-------------------МRYKKIDT-VIVЛЕНГKVYRELKDRCRLIKGTLRNNGYLQLTI----КНKTI
------------MSEVETFVKIEGFE-KYEVSNLГKVRNIKSGRILKP-WIVP-НGYLMHQLCENNKKKНЛ
-------------------МRYKKIDD-LIVFEНГKIYKEMKNKCKLTGLTKSKTGYLMVSV----КГKRM
------------------МВKYRIYEENYIILSНГEVWKIHKNHYRKMKPNKKKNGYWNVSI----ННKAT
-----------------MWVKI-ARNNNYSINEНГМVRNDNTEHIKQP-FTNKDNGYLIVDLYMNNKSEKV
----------------MEWKDIKGYEGHYQISDНГDIFSLKSNRVLKT-MKNKKNGYIYIHLTKDGKKKAF
----------------MEWKDIKGYEGHYRISDНГDIFSLKSNKVLKT-MSNK-НGYTYIHLTKGGKKKСФ
MGFLLYRIRTNGGNLVTKLRKFIKYKEKYМVSDДГEVWEIQKNNLKKKPLSKNNSGYLYTSI----НГKPL
y 6 G 6
GY 6 k
: 52
: 47
: 56
: 47
: 49
: 52
: 54
: 53
: 67
P482_ORF37:
P482_ORF50:
bIL170_E11:
bIL170_E20:
bIL170_E37:
r1t_ORF41:
SP82
:
Пхи-E:
P482_ORF47:
*
*
*
RVHRIVMEAFHG--KSDLTVDHIDГNKEННNLNНЛEYVTQTENAKR-----------FHD-----------
KVHRLVIEAFКГ--KSDLTVDHIDГNKLННSLDНЛQYLTREENLIK-----------SIA-----------
FLHRIIATAFIDNPEEKPQVNHIDENKLННDLNНЛEWCТVKENNIH----GTRMKRIAEKHFKKV------
YVHRLVМЛAFHG--KSDLTVDHLNМNKQDNRLEНЛEYVTAVENIKR-----------ALG-----------
LLHKVITRAFLG--DTTLTVDHIDГNKNННKLSНЛEYVTQAENTRR-----------MFDRTGTDRCSKIG
PIHRLVAEAFIPNPENKATVDHIDГNRKННSIDНЛRWAТYSENNSRFETIGVRSETIIVERFAEERKKRGG
|
ТIHRLVALHFCGGYEESLVVDHIDRNRЧННHFSНЛRWVSRKENSSN---ISADTKKNIITAVRKNAKSQSQ
ТIHRLVALHFCEGYGEDLVVDHIDQDRDННHCSНЛRWVSRKENSNN---ISADTRAKVSEVSKRNARKVSQ
ГVHRIVЛЕAFТГ-YSSEEVAIKIEIKLITVCLILNMFLIKKMYVDT-------------------------
6H466 aF
v h6 n НЛ 5 ы
: 99
: 94
: 117
: 94
: 107
: 123
: 122
: 121
: 112
P482_ORF37:
P482_ORF50:
bIL170_E11:
bIL170_E20:
bIL170_E37:
r1t_ORF41:
SP82
:
Пхи-E:
P482_ORF47:
*
*
*
*
-----KKVLWNGK------EFRSFSDLSRYVGV-ANSTAWKNYSKGYK-----ЛКГHIIEVVK--------
-----IPIYYDNV------КЫРSTNELSRKLNV-SKNTIKYNLNKYGS-----YKГKKLNY----------
---IQLDLNDNVLN-----EFESMVQAEQETGV-SRRNISSCCNGKR------KSAGRFKWRKK-------
-----IKVKWNGK------EFRSFSDLAKYVGV-SHQSVSRNYSKGYK-----ЛКГYIIEVVK--------
KKYSSKKIIWNDI------VFESVSEFCRKTGYKSTSGIAKSVRKGWK-----VKГHLISYL---------
GHLSWLYVIETI-------EFKSISETAKYFNC-TIGNISLMLEKGTIGQRGITRГYQFSYKNRKRSKINS
RSNRKIRPVISISPEGVIRHHRSITQASKETGV-TNASISNNLNKGSR----LMSГYRFLYKDRQLNG---
MTGRKKRPVISISPDGVEKYHGSIMEASRYTGV-GNSSIWKALNKGSV----ПРОЧИТАЛГYKFKHA---RUS---
--------------------------IQKK-----------------------------------------
s
k
г
: 145
: 138
: 166
: 140
: 158
: 186
: 185
: 181
: 116
Page 98 |
3. Результаты
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
или белковых последовательностей содержит, он содержит ДНК(аденин-н6)-Метил Трансфер типичные Асен
Аминокислотные мотивы. Аминокислоты 222-228 имеем последовательность P L-Y-L-D-P-Y. За ним
сохраненная мотив (СМ) II. скрывает консенсус-последовательности для CM I - F-
x-G-x-G (Timinskas et al., 1995). Также эта тема невозможна в ORF 32 между
Аминокислоты 38 до 42 (последовательность F-G-G-G-G) идентифицировать. Расстояние между
два законсервированных объектов примерно соответствует в других представителях
Белка класс найденного расстояния. Чтобы белок ORFs 32 может D12-класс
ДНК(аденин-н6)-Метил Трансфер Асен быть назначены.
ORF
ПИР
PROSITE patterns
Домены PFAM
БЛОКИ
-
-
-
HNH Endonuklease
важное Hüll-
белка
-
-
-
-
АТП-GTP связи
задать мотив A
-
Цинк-зависимые
Фосфолипазы C
Трансмембранный
белка
-
-
-
Гидролазы
-
N-Acetylmuramoyl L-
Аланин Amidase
N-Acetylmuramoyl L-
Аланин Amidase
-
ДНК(аденин-н6)-
метилтрансферазы
-
-
Endodeoxyribo-
нуклеаза
-
HNH-Endonuklease
-
Endodeoxyribo-
нуклеаза
-
HNH-Endonuklease
-
-
АТП-GTP связи
задать мотив A
-
-
Tab. 26. Характерные аминокислотные мотивы в последовательностях из putativen протеины
|
Фаги P482.
Page 99 |
3. Результаты
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
Подготовительные работы к ДНК-чип-гибридизации
3.6.1. Метка ставки на ПЦР, ник Translation и "random грунтованный
labelling"
|
|
Архитектура электронного правительства: Единая архитектура – это методологический подход при создании системы управления государства, который строится...
Биохимия спиртового брожения: Основу технологии получения пива составляет спиртовое брожение, - при котором сахар превращается...
Историки об Елизавете Петровне: Елизавета попала между двумя встречными культурными течениями, воспитывалась среди новых европейских веяний и преданий...
Семя – орган полового размножения и расселения растений: наружи у семян имеется плотный покров – кожура...
© cyberpedia.su 2017-2024 - Не является автором материалов. Исключительное право сохранено за автором текста.
Если вы не хотите, чтобы данный материал был у нас на сайте, перейдите по ссылке: Нарушение авторских прав. Мы поможем в написании вашей работы!