Генетическое разнообразие и происхождение скифских групп — КиберПедия 

История создания датчика движения: Первый прибор для обнаружения движения был изобретен немецким физиком Генрихом Герцем...

Биохимия спиртового брожения: Основу технологии получения пива составляет спиртовое брожение, - при котором сахар превращается...

Генетическое разнообразие и происхождение скифских групп

2019-09-09 186
Генетическое разнообразие и происхождение скифских групп 0.00 из 5.00 0 оценок
Заказать работу

Гаплогруппы, обнаруженные у кочевников железного века, преобладают в современных популяциях как на западе (HV, N1, J, T, U, K, W, I, X), так и на востоке Евразии (A, C, D, F, G, M, Y, Z). Разнообразие митохондриальных гаплотипов в нашем наборе выборок колеблется от 0,958 ± 0,036 в выборке Tagar / Tes (группа № 7 на рис. 2) до 1000 ± 0,039 в ранних сарматах (# 3; дополнительная таблица 7).

Используя данные ядерного SNP, мы выполнили анализ основных компонентов 33 (PCA) из 777 современных западных евразийцев 26, 34,35, на которые мы спроектировали восемь недавно зарегистрированных скифских образцов железного века, а также 167 других древних образцов из Европы, Кавказ и Сибирь из литературы 17, 34, 36 (рис. 4). Два раннесарматских образца с запада (группа № 3 на рис. 2) находятся близко к образцу железного века из Самарского района 34 и, как правило, близки к образцам ранней бронзы в Ямной Самаре 34 и Калмыкии 17и образцы полтавки среднего бронзового века из Самары 34. Восточные образцы из Пазырыка (№ 6), Алды-Бел (№ 5) и Зевакино-Чиликта (№ 4) являются частью рыхлого кластера с другими образцами из Центральной Азии 17, в том числе из Окунево, позднего бронзового века и железного века России. и Карасук. Эти образцы контрастируют с более ранними образцами из Евразийской степи, принадлежащими к группам Андроновская 17, Синташта 17 и Срубная 34, которые перекрывают особей позднего неолита / бронзового века из континентальной Европы 34, 35 и смещены вниз на графике ППШ к ранним фермерам Европа и Анатолия 34.

Рисунок 4: Анализ основных компонентов.

СПС древних особей (по цветам см. Легенду) проецируется на современных западноевразийцев (серый цвет). Скифы железного века изображены черным; CHG, охотник-собиратель Кавказа; LNBA, поздний неолит / бронзовый век; MN, средний неолит; EHG, восточноевропейский охотник-собиратель; LBK_EN, ранний неолитический линейный оркестр; HG, охотник-собиратель; EBA, ранний бронзовый век; IA, железный век; LBA, поздний бронзовый век; WHG, западный охотник-собиратель.

Поскольку СПС Западной Евразии на рис. 4 не позволяет исследовать древние образцы в отношении современных популяций Восточной Азии, мы также провели СПК всех 2345 современных особей в наборе данных «Происхождение человека» 35, на который мы также спроектировали древние особи (рис. 5). Из этого PCA очевидно, что происхождение образцов железного века приходится на континуум между современными западными евразийцами и восточными неафриканцами, что согласуется с анализом митохондриальной гаплогруппы. Восточные скифы демонстрируют почти равные пропорции линий мтДНК, распространенных в восточной и западной Евразии, тогда как в западных скифских группах частота линий, в настоящее время распространенных в восточной Евразии, как правило, ниже, даже достигая нуля в четырех образцах начальной скифской фазы с восьмого по шестое столетие до н.э. (группа № 1 на рис. 2) и достигает 18–26% в более поздние периоды (с шестого по второе столетие до н.э.; № 2 и № 3) (дополнительная таблица 7).

Рисунок 5: Анализ основных компонентов.

PCA древних людей (согласно цветам см. Легенду) проецируется на современных людей из набора данных о происхождении человека (серый). Скифы железного века изображены черным; CHG, охотник-собиратель Кавказа; LNBA, поздний неолит / бронзовый век; MN, средний неолит; EHG, восточноевропейский охотник-собиратель; LBK_EN, ранний неолитический линейный оркестр; HG, охотник-собиратель; EBA, ранний бронзовый век; IA, железный век; LBA, поздний бронзовый век; WHG, западный охотник-собиратель.

f -статистика

Мы использовали f 4-статистику вида f 4 (Test, LBK; EHG, Mbuti) и f 4 (Test, LBK; Han, Mbuti), которые равны нулю для тех тестовых образцов, которые образуют кладу с LBK и положительны для популяций. которые имеют происхождение, связанное с EHG или Ханом, соответственно. Мы нанесли результаты друг на друга, что привело к V-образному рисунку с Ямной на вершине (рис. 6). Скифы железного века расположены вдоль клина от Ямной до Ами (популяция восточноазиатских предков, в которой не было примеси), что соответствует происхождению от популяций, генетически сходных с этими двумя группами.

Рисунок 6: Визуализация результатов f- статистики.

Значения f 4 (Test, LBK; Han, Mbuti) нанесены на ось x, а значения f 4 (Test, LBK; EHG, Mbuti) на оси y, положительные отклонения от нуля показывают отклонения от поля между Test и LBK. Между Ямной из Самары и Ами проведена красная пунктирная линия. Популяции железного века, которые можно смоделировать как смеси ямной и восточно-евразийской (например, ами), расположены вокруг этой линии и, по-видимому, отличаются от основного северно-южноевропейского клина (синего цвета) слева от оси х.

Мы также вычислили статистику в форме f 3 (Test; Yamnaya_Samara, Han), чтобы проверить, имеет ли тестовая популяция промежуточные частоты аллелей между Yamnaya_Samara и Han, которые используются в качестве прокси для возможных исходных популяций. Промежуточные частоты аллелей могут иметь место только в том случае, если тестируемая популяция представляет собой смесь популяций, связанных с этими двумя источниками 37. Эти статистические данные значительно отрицательны для всех скифов, что свидетельствует о наличии примеси (дополнительная рис. 13).

ADMIXTURE анализ

Мы провели анализ ADMIXTURE 38, 39 из 2345 современных людей 35,генотипированных на массиве «Происхождение человека», 35, 37 и 175 древних особей на наборе из 296 340 SNP, пересекающихся с таковыми в массиве «Происхождение человека». Результаты для древних особей показаны на рис. 7 для K = 15, который имеет наибольшее логарифмическое значение правдоподобия (полный анализ можно найти на дополнительной рис. 14). Все степные популяции имеют компоненты предков, которые максимальны у европейских охотников-собирателей (синий) и кавказских охотников-собирателей из Грузии 36(зеленый). Одна подгруппа степных популяций (включая Срубную, Синташту и Андроново) также имеет раннюю фермерскую родословную (оранжевая), в то время как другая подгруппа (включая все образцы железного века) также имеет родословную от компонента (светло-голубой), который максимизируется в нганасане. (Самоеды из Северной Сибири), и распространены среди разнообразных современных людей из Сибири и Центральной Азии. Кроме того, в образцах железного века обнаружен наследственный компонент, который максимально увеличен в популяциях Восточной Азии (желтый), тип родословной, который встречается на уровне следов - если вообще вообще - среди более ранних обитателей степи, в соответствии с наблюдениями от PCA и f -statistics. об этом типе примеси.

Рисунок 7: Результаты ADMIXTURE для древних популяций.

Красные стрелки указывают на изученных скифских особей железного века. LBK_EN: ранний неолитический линейный бандкерамик; EHG: восточноевропейский охотник-собиратель; Motala_HG: охотник-собиратель из Моталы (Швеция); WHG: западный охотник-собиратель; CHG: охотник-собиратель Кавказа; IA: железный век; EBA: ранний бронзовый век; LBA: поздний бронзовый век.


Поделиться с друзьями:

Кормораздатчик мобильный электрифицированный: схема и процесс работы устройства...

Автоматическое растормаживание колес: Тормозные устройства колес предназначены для уменьше­ния длины пробега и улучшения маневрирования ВС при...

Папиллярные узоры пальцев рук - маркер спортивных способностей: дерматоглифические признаки формируются на 3-5 месяце беременности, не изменяются в течение жизни...

Биохимия спиртового брожения: Основу технологии получения пива составляет спиртовое брожение, - при котором сахар превращается...



© cyberpedia.su 2017-2024 - Не является автором материалов. Исключительное право сохранено за автором текста.
Если вы не хотите, чтобы данный материал был у нас на сайте, перейдите по ссылке: Нарушение авторских прав. Мы поможем в написании вашей работы!

0.013 с.