Согласованность проводимых измерений/тестов. — КиберПедия 

Двойное оплодотворение у цветковых растений: Оплодотворение - это процесс слияния мужской и женской половых клеток с образованием зиготы...

Механическое удерживание земляных масс: Механическое удерживание земляных масс на склоне обеспечивают контрфорсными сооружениями различных конструкций...

Согласованность проводимых измерений/тестов.

2021-03-17 65
Согласованность проводимых измерений/тестов. 0.00 из 5.00 0 оценок
Заказать работу

(капа - статистика)

При исследовании болезней дикой птицы важно знать о согласованности результатов стандартных тестов, разработанных ранее, и новых, применяемых при эпизоотологических, клинических, патологоанатомических, серологических и других биологических тестах.

Например: В районе «А», в апреле, популяция одного из видов уток составляла 1800 голов; после заболевания 180 и гибели из них 100, а также дальнейшего перелёта 1100 голов в смежный регион в мае осталось около 600, которые были тестированы на наличие антител, например, к ортомиксовирусу подтипа Н5N1. Были отобраны 60 проб сывороток крови и исследованы методами РН (стандартный), ИФА и РЗГА. Выборка (n) составила 10% (60 проб сывороток крови).

Таблица 7

Согласованность результатов серологических методов РН и ИФА при обнаружении специфических антител к ортомиксовирусу.

 

 

РН

Результат

РН

Всего

p

ИФА   

Всего

 р

«+» «-» «+» «-»
«+» 10 5 15 0,25 12 3 15 0,25
«-» 5 40 45 - 10 35 45 -
Всего   15 45 60 0,25 22 38 60 0,37

Примечание: РЗГА показана далее по тексту (решение 2).

Решение 1.

пункт I. Превалентность (p) РН– 15/60=0,25; p ИФА – 15/60=0,25

пункт II. (10+40)/60=0,83, (0,83*100=83%)

пункт III. 0,25*0,25=0,062, далее (1,0-p)

пункт IV. 0,75*0,75=0,562

пункт V. 0,062*0,562=0,034

пункт VI. 0,83-0,034=0,796

пункт VII. 1,0-0,034=0,966

пункт VIII. 0,796/0,966=0,82, т.е. капа-статистика оказалась выше умеренного уровня согласованности (0,41 – 0,60) и близка к абсолютной согласованности – 83% (пункт II).

Решение 2. РЗГА тоже представляется возможным определить на согласованность со стандартным методом(РН).

пункт I. Превалентность (p) РЗГА=22/60=0,37

пункт II. (12+35)/60=0,78, (0,78*100=78%)

следующие пункты (III - VIII) решения 2 показали капа - статистику – 0,77, что выше 0,60 – верхней границы умеренной согласованности.

Выводы. С учетом положительной превалентности тестов: РН – 0,25, МФА – 0,25 и РЗГА – 0,37 в первом случае оба теста (РН+МФА) оказались позитивными для 16,6% животных, во втором – 20% (РН+РЗГА). Таким образом, все методы в сочетании могут быть использованы для выявления антител, но не напряженности иммунитета, т.е. устойчивости популяции к реинфекции. Возможность повторного заболевания определяют в экспериментальных условиях, где можно выявить и определить:

- наличие специфических антител к возбудителю в градиенте времени, используя вышеуказанные серологические тесты;

- дозу возбудителя для инфицирования, заболевания, развития признаков болезни и (или) летальности (ИД50 и ЛД50);

- согласованность уровня антител и дозы возбудителя для конкретного вида птицы.

- оформление некоторых рекомендаций по контролю за болезнью.

Выявление субклинических болезней, определение эпизоотологических понятий (чувствительность и специфичность), а также перекрестной классификации птицы по состоянию здоровья (больных и здоровых) и результатам теста (положительным и ложноположительным) показаны в пункте 3.4. стр.162-200 в литературном источнике (4), где, используя матрицу формата 2х2 для диагностических исследований, можно провести расчеты и оценку параметров тестов: чувствительность, специфичность, истинную превалентность, мнимую превалентность, предсказательные значения отрицательного и положительного значений теста и отношения правдоподобия к ним, а также долю правильных прогнозов (абсолютную согласованность результатов). Данный раздел биометрических расчетов необходимо применять при использовании ЭМ, ПЦР, ИФА, РГА и других молекулярно-биологических тестов с высокой разрешающей способностью.

 

Метод матчинг (сравнения)

Предназначен для определения антигенного соответствия (показателя r1) между производственными штаммами и эпизоотическими изолятами вируса (или, бактерий, грибов)  с целью определения наиболее родственного производственного штамма для борьбы с болезнью, вызванной конкретным эпизоотическим изолятом, выделенным по факту.

1 этап: на все участвующие в серологических реакциях агенты необходимо получить СС и рассчитать дозы изолятов и штаммов, например 100 ЭЛД50/см2 (ТЦД ЭЛД50/см2).

В качестве референтных СС используются серии (пулы) сывороток крови от 5 особей, иммунизированных однократно моновалентными вакцинами.

 2 этап: в перекрёстной серологической реакции (РН, ИФА, РСК или др.) учитывают  титр референтной сыворотки крови против 100 ЭЛД производственного штамма (гомологичного вируса) и соответствующей дозы изучаемых полевых изолятов (гетерологичного вируса), т.е. титр каждой пробы сыворотки крови определяют в реакции с производственным гомологичным штаммом вируса. Титрование эпизоотического изолята проводят в диагностическом тесте с сывороткой, полученной на производственный штамм агента.

Определение активности сывороток крови

Условное обозначение положительных результатов, соответствующих

разведениям сыворотки крови

Вируснейтрализующая, или, (например)  КС- активность сыворотки крови

разведения lg
1 1:16 1,204
2 1:22 1,342
3 1:32 1,505
4 1:45 1,653
5 1:64 1,806
6 1:90 1,954
7 1:128 2,107
8 1:180 2,255
9 1:256 2,408
10 1:360 2,556
11 1:512 2,709
12 1:720 2,857
13 1:1024 3,010
14 1:1440 3,158
15 1:2048 3,311
16 1:2880 3,459

 

Степень антигенного соответствия (r1) полевого изолята вируса (бактерии) и производственного штамма (аналога) в РН расчитывают по формулам:

r1 = титр* референтной сыворотки крови с гетерологичным вирусом / титр* референтной сыворотки крови с гомологичным вирусом

или  где титр* – величина обратная разведению референтной сыворотки крови, в котором она активна с данным вирусом. lg 1 -активность референтной сыворотки крови с гетерологичным вирусом выраженная в десятичных логарифмах. lg 2  -активность референтной сыворотки крови с гомологичным вирусом выраженная в десятичных логарифмах. При r1 > 0,3 полевой изолят и производственный штамм являются близкородственными, и вакцина из производственного штамма будет защищать от эпизоотического вируса. При r1 < 0,3 полевой изолят отличается от производственного штамма, и вакцина из данного штамма не способна защищать от эпизоотического вируса.

Интерпретация значений r1в ИФА: r1 – 0,4-1,0 – близкое антигенное родство между полевым изолятом и вакцинным штаммом; r1 – 0,2-0,39 – полевой изолят антигенно родственен вакцинному штамму, вакцина из производственного штамма может быть использована, если не будет найдено более родственного штамма и при условии, что птица будет иммунизирована более 1 раза; r1<0,2 – полевой изолят не родственен вакцинному штамму, который не приемлем для защиты от заражения полевым изолятом.

Учёт результатов основного опыта, например, РН.

Производственный штамм и эпизоотические изоляты вируса

Вируснейтрализующая или КС- активность референтной сыворотки

r1

в разведениях в lg
Производственный гомологичный штамм вируса 1:90 1,954 1,0
Эпизоотический изолят №1 1:45 1,653 0,5
Эпизоотический изолят №2 1:45 1,653 0,5
Эпизоотический изолят №3 1:22 1,324 0,35
Эпизоотический изолят №4 1:64 1,806 0,71

 

Разведение референтной сыворотки крови, в котором она активна с гомологичным вирусом (производственным штаммом) – 1:90, величина обратная разведению - 90, Разведение референтной сыворотки крови, в котором она активна с гетерологичным вирусом (эпизоотический изолят №1) – 1:45, величина обратная разведению – 45. Показатель антигенного соответствия (r1):r1 = 45/90 = 0,5 ≥ 0,3.

или r1=10(1,653-1,954)=10-0,3=0,5. Разведение референтной сыворотки крови, в котором она активна с гетерологичным вирусом (эпизоотический изолят №2) – 1:45, величина обратная разведению – 45. Показатель антигенного соответствия (r1): r1 = 45/90 = 0,5. т.е. ≥ 0,3 или r1=10(1,653-1,954)=10-0,3=0,5. Разведение референтной сыворотки крови, в котором она активна с гетерологичным вирусом (эпизоотический изолят №3) – 1:22, величина обратная разведению – 22. Показатель антигенного соответствия (r1):

r1 = 22/90 = 0,24. т.е. < 0,3 или r1=10(1,345-1,954)=10-0,612=0,24.

Разведение референтной сыворотки крови, в котором она активна с гетерологичным вирусом (эпизоотический изолят №3) – 1:64, величина обратная разведению – 64. Показатель антигенного соответствия (r1):r1 = 64/90= 0,71. т.е. ≥ 0,3 или r1=10(1,806-1,954)=

10-0,148=0,71.

Следовательно, полевые изоляты №1, №2, №4 и производственный штамм вируса являются близко родственными и вакцина из этого производственного штамма будет защищать от данных эпизоотических изолятов. Изолят №3 отличается от производственного штамма, следовательно, иммунизация птицы вакциной из производственного штамма может не оказаться эффективной против данного изолята, например, вируса и серовара бактерий.

Корректировку метода матчинг желательно подводить другими методами – контрольным заражением эпизоотическим агентом не менее трёх групп птиц – вакцинированной гомологичной (1) и гетерологичной вакциной (2) в присутствии «чистой» (3),например, при ВГУ или чуме, пастереллёзе и т.д., затем согласованности проводимых измерений и тестов, определения степени патогенности (при гриппе) и др.

 

 


Поделиться с друзьями:

Организация стока поверхностных вод: Наибольшее количество влаги на земном шаре испаряется с поверхности морей и океанов (88‰)...

Биохимия спиртового брожения: Основу технологии получения пива составляет спиртовое брожение, - при котором сахар превращается...

Эмиссия газов от очистных сооружений канализации: В последние годы внимание мирового сообщества сосредоточено на экологических проблемах...

Историки об Елизавете Петровне: Елизавета попала между двумя встречными культурными течениями, воспитывалась среди новых европейских веяний и преданий...



© cyberpedia.su 2017-2024 - Не является автором материалов. Исключительное право сохранено за автором текста.
Если вы не хотите, чтобы данный материал был у нас на сайте, перейдите по ссылке: Нарушение авторских прав. Мы поможем в написании вашей работы!

0.02 с.