Анаболизм нуклеиновых кислот

Исходными веществами для биосинтеза молекул ДНК служат дезокси-

Рисунок 4.12 - Катаболизм пуриновых оснований

Рисунок 4.13 - Катаболизм пиримидиновых оснований

рибонуклеозид-5'-трифосфаты, а специфическое располо­жение нуклеотидных остатков в молекулах ДНК обеспечивается взаимодействием комплементарных оснований, принадлежащих, с одной стороны, полинуклеотидной матрице, а с другой — нуклеозидтрифосфатам. Аналогично идет специфический биосинтез РНК из рибонуклеозидтрифосфатов на ДНК-матрице.

Из трех основных частей нуклеотида (азотистого основания, фос­форной кислоты и пентозы) фосфорная кислота всегда присутст­вует в клетках, рибоза образуется при распаде углеводов, и только гетероциклическое основание создается специфическим путем.

Пути синтеза пуриновых и пиримидиновых оснований различ­ны. Но есть некоторые сходные черты в механизмах синтеза пуринового и пиримидинового циклов:

­ использование глицина, аспарагина и глутамина в качестве источников азота гетероциклических колец;

­ включение в состав пуриновых и пиримидиновых циклов атомов углерода углекислого газа и муравьиной кислоты;

­ построение пуринового основания и завершение синтеза пиримидинового основания на рибозо-5-фосфате, в результате чего конечными продуктами биосинтеза являются сразу нуклеозид-5'-фосфаты;

­ ферментативный характер всех реакций, осуществляющих­ся в процессе синтеза нуклеотидов;

­ возникновение на определенном этапе биосинтеза общих предшественников (инозин-5'-монофосфата — для пуриновых нук­леотидов, уридин-5'-монофосфата — для пиримидиновых).

глицин

Как видно на схеме, два атома азота пуринового кольца происходят из амидной группы глутамина, третий атом азота — из аспартата (аспарагиновой кислоты) и, наконец, четвертый — из глицина. Четвертый и пятый атомы углерода также происходят из глицина. Таким образом, молекула глицина дает три атома. Второй и восьмой атомы углерода происходят из формиата (муравьиной кислоты), а шестой атом углерода — из СО₂:

амидный азот глутамина

ПУРИН

формиат

аспартат

формиат

аспартат

ПИРИМИДИН

Фор­мирование пуринового кольца сразу идет на рибозо-5-фосфате, и в результате последовательных реакций наращивания пурино­вого цикла образуется инозин-5'-монофосфат (ИМФ) — ключе­вое соединение в синтезе пуриновых нуклеотидов. Инозин-5'-фосфат способен окисляться в ксантозин-5'-фосфат.

В результате аминирования инозин-5'-монофосфата синтези­руется аденозин-5'-монофосфат (АМФ), а из АМФ при восста­новлении — дезоксиаденозин-5'-монофосфат (dАМФ). Ксантозин-5'-монофосфат (КМФ) превращается в гуанозин-5'-монофосфат (ГМФ) путем аминирования.

В процессе синтеза пиримидиновых оснований один атом азота цикла пиримидина происходит из аммиака, атом углерода — из углекислого газа, а второй атом азота и остальные атомы углерода — из аспарагиновой кислоты. В результате пос­ледовательных реакций наращивания пиримидинового цикла при дальнейшем участии фосфорилированной рибозы образуется уридин-5'-монофосфат (УМФ) — ключевое соединение в биосинте­зе пиримидиновых нуклеотидов.

Уридин-5'-монофосфат далее превращается в цитидин-5'-мо-нофосфат (ЦМФ), а также в дезоксиуридин-5'-монофосфат (dУМФ) и дезокситимидин-5'-монофосфат (dТМФ).

Пуриновые и пиримидиновые нуклеозид-5'-монофосфаты (НМФ и dНМФ) превращаются в макроэргические нуклеозид-5'-дифосфаты (НДФ и dНДФ), которые далее переходят в богатые энергией нуклеозид-5'-трифосфаты (НТФ и dНТФ). Процессы фосфорилирования нуклеотидов идут при их взаимодействии с уни­версальным источником энергии АТФ при участии специфических фосфотрансфераз (киназ).

Синтез дезоксирибонуклеозид-5'-трифосфатов (dНТФ) осуще­ствляется посредством реакции восстановления рибозы по гидроксильной группе при втором углеродном атоме. Эта реакция свой­ственна как нуклеозидмонофосфатам, так и нуклеозиддифосфатам.

Биосинтез всех дезоксирибонуклеозид-5'-трифосфатов и рибонуклеозид-5'-трифосфатов регулируется в клетке таким образом, что они возникают зависимо друг от друга в строго определенных соотношениях.

ОБМЕН ЛИПИДОВ

Жиры — основной источник энергии в организме. Жиры зна­чительно превосходят по энергетической ценности углеводы и в значительных количествах могут запасаться в качестве «резервно­го топлива».

Характерным структурным компонентом большинства липи­дов являются высшие жирные кислоты. В состав жи­ров чаще всего входят кислоты с 16— 18 атомами углерода, среди них имеются насыщенные и ненасыщенные высшие жирные кислоты.

КАТАБОЛИЗМ ЛИПИДОВ

Распад жиров (триглицеридов) начинается с их гидролиза, в результате чего образуются глицерин и высшие жирные кислоты. Гидролиз триглицеридов, входящих в состав пищи, у высших животных происходит преимущественно в тонком кишечнике и катализируется липолитическими ферментами — панкреатиче­скими липазами, вырабатываемыми поджелудочной железой.

Эти ферменты бывают двух типов: одни из них специфичны в отношении эфирных связей в a-положении триглицерида, другие гидролизуют связи в b-положении.

Полный гидролиз триглицеридов идет ступенчато: сначала быстро гидролизуются a-связи, а потом уже идет медленный гид­ролиз b-моноглицерида:

жирная кислота

алиэстераза

липаза

липаза

жирная кислота

жирная кислота

глицерин

моноацилглицерид

диацилглицерид

триацилглицерид

 

Глицерин независимо от того, поступит ли он на ресинтез жиров или будет претерпевать дальнейший распад, прежде всего фосфорилируется. Донором остатка фосфорной кислоты в этой реакции служит АТФ. Образующийся фосфоглицерин в основном расходуется на синтез новых мо­лекул триглицеридов, но часть его окисляется с образованием диоксиацетонфосфата.

Диоксиацетонфосфат изомеризуется в 3-фосфоглицериновый альдегид, который затем вступает в обменные реакции.

Высшие жирные кислоты распадаются преимущественно пу­тем b-окисления, получившего такое название потому, что в молекуле жирной кислоты оксиление протекает по b-углеродному атому, при этом от кислоты отщепляется двууглеродный фрагмент. Ненасыщенные высшие жирные кислоты (олеи­новая, линолевая, линоленовая и др.) предварительно восстанав­ливаются до предельных кислот. Окисление предельных высших жирных кислот осуществляется ступенчато. Все реакции многостадий­ного окисления ускоряются специфическими ферментами. b-Окисление высших жирных кислот у млекопитающих происходит во многих тканях, в первую очередь в печени, почках и сердце.

Первым этапом b-окисления высших жирных кислот является их активирование путем образования соединения с коэнзимом А (HS-КоА). Эта реакция протекает в цитоплазме с использованием энергии АТФ и приводит к образованию ацилкоэнзима А (ацил-SКоА). Взаимо­действие высших жирных кислот с коэнзимом А ускоряется спе­цифическими лигазами — ацил-SКоА-синтетазами:

С₁₇Н₃₅-СООН + HS-KoA + АТФ ¾¾¾® С₁₇Н₃₅-СО~ S-KoA + АМФ + ФФ_н

Вторая стадия распада высших жирных кислот состоит в окис­лении ацилкоэнзима А при посредстве ацил-SКоА-дегидрогеназы, содержащей ФАД⁺ в качестве кофермента (рисунок 4.14, реакция 1).

Третья стадия окисления высших жирных кислот состоит в присоединении молекулы воды (гидратация) по месту двойной связи дегидроацил-КоА. Эта реакция ускоряется соответствующими гидролиазами (еноил-SКоА-гидратазами) (реакция 2).

Четвертая стадия распада высших жирных кислот заключает­ся в их новом окислении путем отнятия двух атомов водорода (дегидрирование) в b-положении по отношению к карбоксильной группе (реакция 3). Реакция катализируется оксидоредуктазой, но (в отличие от первой стадии окисления) с участием НАД⁺ в качестве кофермента.

Пятая стадия распада заключается в переносе b-кетоацил-SКоА-ацильной группировки на новую молекулу коэнзима А. Этот процесс ускоряется соответствующей ацилтрансферазой, называемой тиолазой, поскольку реакция по существу представляет расщепление связи -С—С- с присоедине­нием по месту разрыва элементов HS-группы (тиолиз или тиолитическое расщепление) (реакция 4).

В результате описанных выше реакций молекула высшей жир­ной кислоты (стеариновой в рассматриваемом примере) укора­чивается на два углеродных атома, и образуются пальмитиновая и уксусная кислоты в виде производных коэнзима А (пальмитил- и ацетил-SКоА). Этот процесс многократно повторяется. Так, пальмитил-SКоА снова дегидрируется, затем гидратируется, еще раз дегидрируется и расщепляется на С₁₃Н₂₇-CO~S-KoA и новую молекулу ацетил-SКоА. В свою очередь C₁₃H₂₇-CO~S-KoA дает С₁₁Н₂₃-CO~S-КоА и еще молекулу ацетил-SКоА и т.д. (рисунок 4.14).

Окончательным продуктом b-окисления выс­ших жирных кислот в организме является ацетил-SКоА.

-обозначает повторение реакций 1-4

тиолитическое расщепление

гидратация

дегидрирование

дегидрирование

Рисунок 4.14 - Реакции b-окисления жирных кислот

(на примере стеариновай кислоты)

b-Окисление высших жирных кислот протекает в митохондри­ях, в липопротеидной мембране которых расположены ансамбли ферментов, обеспечивающих ряд индивидуальных реакций, со­ставляющих процесс b-окисления. Поскольку в митохондриях локализованы также ферменты дыхательного цикла, ведущие передачу атомов водорода и электронов на кислород сопряжен­но с окислительным фосфорилированием, b-окисление высших жирных кислот является источником энергии для синтеза АТФ.

В процессе распада пальмитиновой кислоты проходит 7 циклов b-окисления, в каждом из которых образуются 5 молекул АТФ (посредством восстановленных ФАДН₂ и НАДН ^. Н⁺).

При окислении пальмитата до ацетил-SКоА обра­зуются 35 молекул АТФ. Восемь молекул ацетил-SКоА дают в ре­зультате полного сгорания в цикле Кребса 8 ^. 12 = 96 молекул АТФ. Одна молекула АТФ затрачивается на активирование пальмитата. Следовательно, энергетический эффект составляет 130 молекул АТФ.

Если бы ацетил-SКоА накапливался в организме, то запасы HS-КоА быстро исчерпались бы, и окисление высших жирных кислот остановилось. Этого не происходит, так как HS-КоА бы­стро освобождается из состава ацетил-SКоА в результате следую­щих процессов:

¾ ацетил-SКоА включается в ЦТК, где окисляется до СО₂ и Н₂О;

¾ ацетил-SКоА используется для синтеза полициклических спиртов (стеролов) и соединений, содержащих изопреноидные группировки;

¾ ацетил-SКоА явля­ется универсальным донором ацетильных групп для реакций ацетилирования (синтез ацетилхолина, N-ацетилглюкозамина и т.п.).

Основная масса природных липидов содержит жирные кислоты с четным числом атомов углерода. Однако в липидах растений инекоторых морских организмов присутствуют жирные кислоты с нечетным числом атомов углерода в цепи. Кроме того, у жвачных животных, в процессе переваривания углеводов в рубце образуется большое количество пропионовой кислоты, которая содержит три атома углерода. Жирные кислоты с нечетным числом атомов углерода окисляются таким же образом, что и кислоты с четным числом атомов, с той лишь разницей, что на последнем этапе b-окисления образуется одна молекула ацетил-SКоА и одна молекула пропионил-SКоА. Последний затем карбоксилируется и включается в дальнейшее окисление в форме сукцинил-SКоА (рисунок 4.15).

Расщепление ненасыщенных жирных кислот в ходе b-окисления происходит через дополнительные стадии гидратации по месту двойной связи между вторым и третим атомами углерода.

Обязательным условием в таком случае является наличие транс -двойной связи. В случае цис -изомера жирной кислоты необходим дополнительный фермент – цис-транс -изомераза. D-изомер, образующийся в ходе гидратации цис -связи, преобразуется ферментом эпимеразой в L-форму жирной кислоты. После таких преобразований цикл b-окисления продолжается как обычно (рисунок 4.16).

катаболизм некоторых аминоксилот (триптофан, изолейцин, метионин)

 

b-окисление

ЦТК

пропионил-SКоА

Метилмалонил-SКоА

жирная кислота (n-нечетное число)

	сукцинил-SКоА

Рисунок 4.15 - b-Окисление жирных кислот с нечетным числом